Il Museo Archeologico è la nuova dimora dell'Uomo venuto dal ghiaccio, la mummia di circa 5300 anni rinvenuta sul ghiacciaio del Similaun. Comprende la storia altoatesina dagli albori al primo Medioevo con reperti originali, modelli, ologrammi, video e guide acustiche.
La mummia è conservata al primo piano assieme alla storia del ritrovamento e alle tematiche di natura medico-scientifica.

Collocato nella sede principesca di riscossione dei censi fondiari e dei diritti di dogana (Massimiliano I - XVI secolo). Su una superficie di 1000 mq viene rappresentata la varietà del paesaggio altoatesino, in particolare la genesi delle Dolomiti. Suggestivo percorso a temi della realtà geologica del territorio. Il museo ospita regolarmente apprezzate mostre di carattere scientifico.
Interessante l'acquario marino.

Allestito nel Palazzo Mercantile, già sede prestigiosa del Magistrato Mercantile, istituito nel 1653, il museio ripercorre la storia economica della città di Bolzano. L'Intinerario cronologico si articola tra salette di riunione, stanza de cancelliere, salon d'onore con i pregevoli arredi d'epoca barocca, i documenti di archivio, i quadri e gli oggetti d'arte originali.

Fondato nel 1987, presenta artisti e opere d'arte moderna e contemporanea con mostre temporanee e azioni nello spazio pubblico. In occasione di mostre temporanee è possibile vedere le opere in collezione. Per il 2005 è previsto un nuovo museo, progettato dagli architetti berlinesi KSV Krüger Schuberth Vandreike.

Collocato nella torre romanica dell'Abbazia, mostra presepi antichi di cui uno risalente al 1750 circa e una rassegna dell'attuale produzione di presepi in Alto Adige, nonché una quarantina di pezzi di gruppi di figure di arte popolare.

Il cuore dei musei di Reinhold Messner trova spazio tra le antiche mura di Castel Firmiano, rese accessibili da una struttura moderna in vetro e acciaio. Il percorso espositivo si snoda tra le torri, le sale, i cortili ed offre al visitatore una visione d’insieme dell’universo montagna. Opere, quadri, cimeli, reperti naturali raccontano lo stretto rapporto che unisce l’uomo alla montagna, l’orogenesi delle catene montuose ed il loro disfacimento, il legame tra montagna e religione, la maestosità delle vette più famose del mondo, la storia dell’alpinismo fino all’odierno turismo alpino. Mostra temporanea annuale.

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